眼见仇鸾被直接拖出去砍了，众将士只觉无比解气，而且斗志昂扬，纷纷请求出兵，一鼓作气收复玉门关，以彻底断绝叶尔羌人的退路和补给线。
徐晋自然没意见，立即下令戚景通和王林儿二人率四千神机营攻打玉门关。考虑到玉门关只是一座小关城，防御力跟敦煌相比差很远，所以徐晋把西宁卫也派了上去，正好借机让这些怂兵锻炼一下胆气。
正所谓以其人之道，还治其人之身。当初叶尔羌人攻破嘉峪关时，把嘉峪关的游击将军汪伯诚，以及肃州卫指使同知窦宏武的人头砍下，挂在竹竿上向肃州城中的明军示威。
所以徐晋这次也命人把万夫长罗格尔，及其麾下所有千夫长的脑袋都砍下来，用竹竿挂成一串儿，拿到玉门关下示威。
果然，玉门关中的叶尔羌守军见到那一串血淋淋的人头，无不骇得心惊肉跳，士气大受打击。
玉门关又叫小方盘城，面积本来就很小，无论是城墙的高度和厚度，与敦煌城相比都不可同日而语，而且由于面积小，最多只能驻兵两千人左右，事实上，此刻玉门关中的守兵只有一千出头。
不过也难怪叶尔羌的主帅巴伊麻痹大意的，毕竟嘉峪关和肃州都掌握在他手里，哈密的明军又被困得死死的，他哪料到竟然会有一支明军能绕到后方爆了自己菊花呢。
所以在神机营几十门佛朗机炮的狂轰滥炸下，玉门关只是半天时间不到就被攻破了，城中的千余守军也被毫不留情的屠杀一空。
“以牙还牙，以血还血！”这是徐晋在出兵前对众将士说过的狠话，对待亦卜剌部可以网开一面，但对胆敢向大明呲牙，残杀大明将士的叶尔羌，必然给予沉重的教训，彻底打痛打怕，最好让这些叶尔羌人以后见到明军的旗帜都闻风丧胆，大小便失禁！
嘉靖七年三月初五、初六、初七，短短三天时间，北靖王以迅雷不及掩耳之势，收复了敦煌一线三关，切断了叶尔羌军队的退路和补给线，迅速扭转了关外的局势，这次轮到叶尔羌的军队成为孤军了。
叶尔姜的军队远道而来，补给本来就十分困难，如今丢了敦煌一线三关，几乎等于被判了死刑，当然，叶尔羌军队如果放弃嘉峪关和肃州，在瓜州集结兵力反扑，或许还有一线生机，否则就等着被包饺子吧。
当然，如果叶尔羌的主帅舍得，也可以连瓜州也放弃掉，直接全军撤往哈密，背靠吐鲁番，这样也可以避免被明军包饺子，只是叶尔羌的主帅他舍得吗？更何况他未必就完全信任吐鲁番。
且说神机营拿下了玉门关后便按兵不动了，只派人用竹竿挑着叶尔羌将领的人头，分别跑到瓜州城和嘉峪关外耀武扬威。
所以，敦煌三关已经被明军攻陷的消息很快便传到了肃州，叶尔羌三军主帅——巴伊的耳中。
这坏消息不啻于晴天一记霹雳，把这位叶尔羌的三军主帅天劈得天旋地转，怒急攻心之下，一口鲜血喷涌而出，一如当初俞大猷听到嘉峪关和肃州失陷时的反应。
套用一句话时髦的话：出来混，迟早都要还的！